با توجه به وجود ظرفیت‌های مناسب علمی و پژوهشی در دانشگاه علوم توانبخشی و سلامت اجتماعی جهت به‌کارگیری نخبگان وظیفه در قالب طرح جایگزین خدمت وظیفه و به دنبال امضای تفاهم‌نامه با مرکز نخبگان و استعدادهای برتر نیروهای مسلح، معاونت تحقیقات و فناوری دانشگاه  اقدام به جذب و به‌کارگیری نخبگان و استعدادهای برتر وظیفه نمود.

برابر تفاهم‌نامه امضا شده بین دانشگاه و مرکز نخبگان و استعدادهای برتر نیروهای مسلح، متقاضیانی که از سوی بنیاد نخبگان و استعدادهای برتر نیروهای مسلح، نخبه بودن آنها احراز شود، می‌توانند خدمت سربازی خود را تحت عنوان سرباز نخبه و در قالب طرح جایگزین خدمت در یکی از بیمارستان‌ها، مراکز تحقیقات و یا گروه‌های آموزشی بگذرانند.

اعلام نیازهای ارائه شده، در معاونت تحقیقات و فناوری دانشگاه علوم توانبخشی و سلامت اجتماعی مورد بررسی قرار می‌گیرد و فرد متقاضی به معاونت تحقیقات و فناوری وزارت بهداشت معرفی خواهد شد تا در صورت اخذ موافقت وزارت بهداشت، جهت اقدامات بعدی به مرکز نخبگان و استعدادهای برتر نیروهای مسلح معرفی گردد.

کلیه رشته‌های تخصصی این دانشگاه در حوزه‌های توانبخشی، سلامت اجتماعی و سلامت روان دارای قابلیت جذب سرباز نخبه می‌باشند.